Docker integreras i Hadoop, särskilt YARN, för att förbättra hanteringen av applikationscontainrar och prestanda. IBM:s benchmarktester visar att Docker ger betydande prestandafördelar (CPU, minne, driftstid) jämfört med traditionell virtualisering som KVM. Målet med integrationen är att förenkla hanteringen av mjukvaruberoenden för utvecklare som använder Hadoop, genom att möjliggöra paketering av hela applikationsmiljöer. Företag som Altiscale och Hortonworks är aktiva i utvecklingen och ser Docker som en lösning för att hantera olika mjukvarukrav och skapa förutsägbara körmiljöer inom Hadoop. Stora teknikföretag som Red Hat och Amazon har också anammat Docker, vilket understryker dess växande betydelse som verktyg för paketering och distribution av mjukvara.