Vid uppgradering av Wordpress är det avgörande att Databasens schema uppdateras korrekt, annars kommer WordPress att omdirigera till en databasuppgraderingssida. Normalt krävs inte aktivering eller avaktivering av plugins vid uppgradering av Wordpress kärna, men det kan vara nödvändigt i driftsatta miljöer där uppgraderingsprocessen sker på en annan maskin med en separat databas. Automatisering av plugin-aktivering/avaktivering kan uppnås genom att utveckla ett anpassat Wordpress-plugin som använder befintliga WordPress-funktioner som activate_plugin() och deactivate_plugins(). Capistrano kan användas för att trigga en URI till ett sådant anpassat plugin, men själva den interna logiken för plugin-hantering måste hanteras inom Wordpress-applikationen.