Kali NetHunter App Store är en ny appbutik för Android-enheter, dedikerad till säkerhetsrelaterade applikationer. Den fungerar som ett alternativ till Google Play Store för alla Android-enheter, oavsett om de är rootade eller inte. Butiken drivs av en modifierad version av F-Droid och har ett starkt fokus på användarnas integritet genom att ha tagit bort funktioner för telemetri och kraschrapportering. Inkluderingspolicyn har breddats för att även tillåta proprietära applikationer.