Tatu Ylonen, uppfinnaren av SSH, varnar för en allvarlig säkerhetsrisk kopplad till bristfällig hantering av SSH-nycklar. Han menar att organisationer ofta tillåter SSH-nyckelfiler att spridas okontrollerat på nätverken, vilket skapar enkla ingångar för intrång. Varningen ifrågasätts dock av vissa, som anser att problemet överdrivs och att det handlar om grundläggande funktioner för lösenordsfri inloggning snarare än en ny sårbarhet.