SQLite garanterar sin tillförlitlighet genom en omfattande testprocess som innefattar 590 gånger mer testkod än själva kärnbiblioteket. Fyra oberoende testsviter – Tcl, th3, SQL Logic Test och dbsqlfuzz – används för olika ändamål, inklusive utvecklingstester, 100% kodtäckning, jämförelse med andra databasmotorer och fuzz-testning. Utöver de primära testsviterna finns specialiserade program för att testa prestanda, samtidighet (flera processer och trådar) och JSONB-input. Anomalitestning, som simulerar minnesbrist (OOM) och I/O-fel, är avgörande för att säkerställa SQLite:s robusthet under ogynnsamma förhållanden, särskilt för inbyggda system. Innan varje kodändring kör utvecklare en snabb delmängd av Tcl-testerna, och alla tester måste godkännas på flera plattformar och konfigurationer före varje ny release.